Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LAMC1P11047 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LAMC1P11047 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
LAMC1P11047 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LAMC1P11047 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LAMC1P11047 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LAMC1P11047 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
LAMC1P11047 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LAMC1P11047 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LAMC1P11047 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LAMC1P11047 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LAMC1P11047 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LAMC1P11047 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LAMC1P11047 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LAMC1P11047 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LAMC1P11047 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
LAMC1P11047 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LAMC1P11047 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LAMC1P11047 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LAMC1P11047 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LAMC1P11047 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LAMC1P11047 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LAMC1P11047 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LAMC1P11047 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LAMC1P11047 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LAMC1P11047 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LAMC1P11047 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LAMC1P11047 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LAMC1P11047 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LAMC1P11047 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LAMC1P11047 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LAMC1P11047 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LAMC1P11047 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LAMC1P11047 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LAMC1P11047 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LAMC1P11047 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LAMC1P11047 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LAMC1P11047 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LAMC1P11047 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LAMC1P11047 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LAMC1P11047 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LAMC1P11047 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
LAMC1P11047 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LAMC1P11047 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LAMC1P11047 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LAMC1P11047 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LAMC1P11047 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
LAMC1P11047 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LAMC1P11047 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LAMC1P11047 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
LAMC1P11047 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LAMC1P11047 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LAMC1P11047 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LAMC1P11047 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LAMC1P11047 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LAMC1P11047 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LAMC1P11047 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LAMC1P11047 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LAMC1P11047 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LAMC1P11047 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LAMC1P11047 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LAMC1P11047 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LAMC1P11047 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LAMC1P11047 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LAMC1P11047 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LAMC1P11047 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LAMC1P11047 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LAMC1P11047 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LAMC1P11047 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.8
LAMC1P11047 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LAMC1P11047 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LAMC1P11047 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LAMC1P11047 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LAMC1P11047 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LAMC1P11047 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
LAMC1P11047 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LAMC1P11047 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LAMC1P11047 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LAMC1P11047 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LAMC1P11047 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LAMC1P11047 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LAMC1P11047 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LAMC1P11047 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LAMC1P11047 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
LAMC1P11047 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LAMC1P11047 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LAMC1P11047 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
LAMC1P11047 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LAMC1P11047 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LAMC1P11047 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
LAMC1P11047 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LAMC1P11047 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
LAMC1P11047 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LAMC1P11047 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LAMC1P11047 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
LAMC1P11047 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LAMC1P11047 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LAMC1P11047 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LAMC1P11047 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LAMC1P11047 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.5 ms