Protein–RNA interactions for Protein: P09603

CSF1, Macrophage colony-stimulating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1P09603 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSF1P09603 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSF1P09603 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSF1P09603 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSF1P09603 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSF1P09603 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSF1P09603 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSF1P09603 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSF1P09603 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSF1P09603 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSF1P09603 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSF1P09603 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSF1P09603 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSF1P09603 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSF1P09603 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSF1P09603 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSF1P09603 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSF1P09603 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSF1P09603 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSF1P09603 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CSF1P09603 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSF1P09603 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSF1P09603 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSF1P09603 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSF1P09603 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSF1P09603 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSF1P09603 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSF1P09603 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSF1P09603 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSF1P09603 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSF1P09603 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSF1P09603 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSF1P09603 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSF1P09603 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSF1P09603 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSF1P09603 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSF1P09603 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CSF1P09603 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSF1P09603 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSF1P09603 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSF1P09603 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSF1P09603 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSF1P09603 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CSF1P09603 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSF1P09603 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CSF1P09603 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSF1P09603 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSF1P09603 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSF1P09603 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CSF1P09603 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSF1P09603 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSF1P09603 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSF1P09603 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSF1P09603 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSF1P09603 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSF1P09603 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSF1P09603 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSF1P09603 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSF1P09603 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CSF1P09603 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSF1P09603 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSF1P09603 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSF1P09603 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSF1P09603 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSF1P09603 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CSF1P09603 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CSF1P09603 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CSF1P09603 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CSF1P09603 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF1P09603 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF1P09603 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF1P09603 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF1P09603 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF1P09603 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF1P09603 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF1P09603 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF1P09603 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF1P09603 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF1P09603 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF1P09603 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF1P09603 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF1P09603 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF1P09603 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF1P09603 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF1P09603 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF1P09603 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF1P09603 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF1P09603 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF1P09603 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF1P09603 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF1P09603 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF1P09603 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF1P09603 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF1P09603 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF1P09603 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF1P09603 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF1P09603 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF1P09603 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF1P09603 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF1P09603 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms