Protein–RNA interactions for Protein: P01893

HLA-H, Putative HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain H, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-HP01893 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms