Protein–RNA interactions for Protein: O75390

CS, Citrate synthase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSO75390 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSO75390 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSO75390 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSO75390 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSO75390 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSO75390 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSO75390 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSO75390 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSO75390 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSO75390 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSO75390 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSO75390 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CSO75390 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CSO75390 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSO75390 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSO75390 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSO75390 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSO75390 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSO75390 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSO75390 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSO75390 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSO75390 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSO75390 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSO75390 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSO75390 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSO75390 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSO75390 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSO75390 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSO75390 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSO75390 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSO75390 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSO75390 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSO75390 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSO75390 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSO75390 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSO75390 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSO75390 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSO75390 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSO75390 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSO75390 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSO75390 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSO75390 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CSO75390 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSO75390 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSO75390 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSO75390 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSO75390 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSO75390 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSO75390 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSO75390 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSO75390 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CSO75390 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CSO75390 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CSO75390 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSO75390 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CSO75390 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSO75390 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CSO75390 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSO75390 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSO75390 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSO75390 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSO75390 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSO75390 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSO75390 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSO75390 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSO75390 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSO75390 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSO75390 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSO75390 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSO75390 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSO75390 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSO75390 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSO75390 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSO75390 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSO75390 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSO75390 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSO75390 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSO75390 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CSO75390 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSO75390 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSO75390 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSO75390 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSO75390 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSO75390 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSO75390 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSO75390 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSO75390 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSO75390 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSO75390 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSO75390 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSO75390 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSO75390 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSO75390 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CSO75390 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSO75390 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSO75390 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CSO75390 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSO75390 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSO75390 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSO75390 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms