Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNSO60931 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNSO60931 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNSO60931 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNSO60931 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNSO60931 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNSO60931 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNSO60931 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNSO60931 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNSO60931 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNSO60931 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNSO60931 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNSO60931 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNSO60931 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNSO60931 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNSO60931 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNSO60931 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNSO60931 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNSO60931 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNSO60931 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNSO60931 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNSO60931 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNSO60931 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNSO60931 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNSO60931 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNSO60931 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNSO60931 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNSO60931 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNSO60931 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNSO60931 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNSO60931 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNSO60931 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNSO60931 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNSO60931 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNSO60931 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNSO60931 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNSO60931 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNSO60931 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNSO60931 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNSO60931 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNSO60931 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNSO60931 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNSO60931 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNSO60931 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNSO60931 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNSO60931 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNSO60931 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNSO60931 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNSO60931 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNSO60931 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNSO60931 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNSO60931 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNSO60931 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNSO60931 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNSO60931 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNSO60931 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNSO60931 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNSO60931 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNSO60931 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNSO60931 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNSO60931 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNSO60931 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNSO60931 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNSO60931 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNSO60931 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNSO60931 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNSO60931 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNSO60931 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNSO60931 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNSO60931 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNSO60931 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNSO60931 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNSO60931 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNSO60931 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNSO60931 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNSO60931 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNSO60931 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNSO60931 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNSO60931 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNSO60931 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNSO60931 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNSO60931 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNSO60931 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNSO60931 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNSO60931 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNSO60931 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNSO60931 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNSO60931 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNSO60931 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNSO60931 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNSO60931 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNSO60931 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNSO60931 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTNSO60931 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTNSO60931 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTNSO60931 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTNSO60931 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTNSO60931 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTNSO60931 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTNSO60931 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms