Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PPLO60437 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PPLO60437 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.8
PPLO60437 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PPLO60437 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PPLO60437 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PPLO60437 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PPLO60437 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PPLO60437 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PPLO60437 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PPLO60437 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PPLO60437 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PPLO60437 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PPLO60437 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PPLO60437 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PPLO60437 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PPLO60437 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PPLO60437 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PPLO60437 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PPLO60437 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PPLO60437 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PPLO60437 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PPLO60437 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PPLO60437 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PPLO60437 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PPLO60437 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PPLO60437 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PPLO60437 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PPLO60437 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PPLO60437 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PPLO60437 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PPLO60437 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PPLO60437 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PPLO60437 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PPLO60437 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PPLO60437 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PPLO60437 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PPLO60437 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PPLO60437 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PPLO60437 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PPLO60437 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PPLO60437 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PPLO60437 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PPLO60437 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PPLO60437 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PPLO60437 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PPLO60437 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PPLO60437 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PPLO60437 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PPLO60437 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PPLO60437 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PPLO60437 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PPLO60437 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PPLO60437 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PPLO60437 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PPLO60437 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PPLO60437 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PPLO60437 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PPLO60437 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PPLO60437 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PPLO60437 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PPLO60437 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PPLO60437 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PPLO60437 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PPLO60437 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PPLO60437 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PPLO60437 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PPLO60437 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PPLO60437 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PPLO60437 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PPLO60437 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PPLO60437 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PPLO60437 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PPLO60437 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PPLO60437 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PPLO60437 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PPLO60437 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PPLO60437 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PPLO60437 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PPLO60437 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PPLO60437 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PPLO60437 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PPLO60437 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PPLO60437 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PPLO60437 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PPLO60437 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PPLO60437 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PPLO60437 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PPLO60437 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PPLO60437 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PPLO60437 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PPLO60437 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PPLO60437 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PPLO60437 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PPLO60437 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PPLO60437 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PPLO60437 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PPLO60437 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PPLO60437 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PPLO60437 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms