Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAK2O60296 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAK2O60296 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAK2O60296 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAK2O60296 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAK2O60296 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAK2O60296 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAK2O60296 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAK2O60296 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAK2O60296 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAK2O60296 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAK2O60296 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAK2O60296 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAK2O60296 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAK2O60296 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAK2O60296 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAK2O60296 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAK2O60296 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAK2O60296 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAK2O60296 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAK2O60296 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAK2O60296 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAK2O60296 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAK2O60296 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAK2O60296 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAK2O60296 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAK2O60296 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAK2O60296 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAK2O60296 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAK2O60296 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAK2O60296 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAK2O60296 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAK2O60296 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAK2O60296 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAK2O60296 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAK2O60296 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAK2O60296 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAK2O60296 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAK2O60296 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAK2O60296 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAK2O60296 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAK2O60296 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAK2O60296 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAK2O60296 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAK2O60296 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAK2O60296 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAK2O60296 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAK2O60296 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAK2O60296 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAK2O60296 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAK2O60296 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAK2O60296 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAK2O60296 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAK2O60296 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAK2O60296 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAK2O60296 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAK2O60296 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAK2O60296 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAK2O60296 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAK2O60296 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAK2O60296 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAK2O60296 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAK2O60296 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAK2O60296 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAK2O60296 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAK2O60296 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAK2O60296 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAK2O60296 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAK2O60296 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAK2O60296 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAK2O60296 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAK2O60296 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAK2O60296 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAK2O60296 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAK2O60296 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAK2O60296 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAK2O60296 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAK2O60296 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAK2O60296 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAK2O60296 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAK2O60296 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAK2O60296 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAK2O60296 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAK2O60296 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAK2O60296 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAK2O60296 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRAK2O60296 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRAK2O60296 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRAK2O60296 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRAK2O60296 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRAK2O60296 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRAK2O60296 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRAK2O60296 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRAK2O60296 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRAK2O60296 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRAK2O60296 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms