Protein–RNA interactions for Protein: O43921

EFNA2, Ephrin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA2O43921 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFNA2O43921 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFNA2O43921 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFNA2O43921 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFNA2O43921 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFNA2O43921 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFNA2O43921 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
EFNA2O43921 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFNA2O43921 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFNA2O43921 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
EFNA2O43921 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA2O43921 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA2O43921 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA2O43921 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA2O43921 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA2O43921 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA2O43921 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA2O43921 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA2O43921 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA2O43921 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA2O43921 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA2O43921 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA2O43921 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA2O43921 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA2O43921 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA2O43921 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA2O43921 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA2O43921 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA2O43921 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA2O43921 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA2O43921 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA2O43921 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA2O43921 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA2O43921 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA2O43921 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA2O43921 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA2O43921 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA2O43921 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA2O43921 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA2O43921 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA2O43921 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA2O43921 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA2O43921 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA2O43921 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA2O43921 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA2O43921 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA2O43921 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA2O43921 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA2O43921 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA2O43921 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNA2O43921 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNA2O43921 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNA2O43921 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNA2O43921 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNA2O43921 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNA2O43921 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNA2O43921 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNA2O43921 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNA2O43921 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNA2O43921 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNA2O43921 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNA2O43921 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNA2O43921 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNA2O43921 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNA2O43921 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNA2O43921 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNA2O43921 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNA2O43921 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNA2O43921 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNA2O43921 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNA2O43921 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNA2O43921 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNA2O43921 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNA2O43921 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNA2O43921 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNA2O43921 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNA2O43921 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNA2O43921 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNA2O43921 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNA2O43921 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNA2O43921 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNA2O43921 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNA2O43921 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNA2O43921 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNA2O43921 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNA2O43921 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNA2O43921 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNA2O43921 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNA2O43921 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EFNA2O43921 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EFNA2O43921 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EFNA2O43921 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EFNA2O43921 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EFNA2O43921 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EFNA2O43921 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EFNA2O43921 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EFNA2O43921 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EFNA2O43921 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EFNA2O43921 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EFNA2O43921 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms