Protein–RNA interactions for Protein: O15259

NPHP1, Nephrocystin-1, humanhuman

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP1O15259 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NPHP1O15259 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NPHP1O15259 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NPHP1O15259 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NPHP1O15259 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NPHP1O15259 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NPHP1O15259 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NPHP1O15259 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NPHP1O15259 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NPHP1O15259 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NPHP1O15259 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NPHP1O15259 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NPHP1O15259 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NPHP1O15259 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NPHP1O15259 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPHP1O15259 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPHP1O15259 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPHP1O15259 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPHP1O15259 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPHP1O15259 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPHP1O15259 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPHP1O15259 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPHP1O15259 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPHP1O15259 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPHP1O15259 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPHP1O15259 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NPHP1O15259 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NPHP1O15259 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPHP1O15259 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NPHP1O15259 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPHP1O15259 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPHP1O15259 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPHP1O15259 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPHP1O15259 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPHP1O15259 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NPHP1O15259 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NPHP1O15259 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NPHP1O15259 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NPHP1O15259 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NPHP1O15259 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NPHP1O15259 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms