Protein–RNA interactions for Protein: O15015

ZNF646, Zinc finger protein 646, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF646O15015 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZNF646O15015 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZNF646O15015 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZNF646O15015 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZNF646O15015 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms