Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHLHE40O14503 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHLHE40O14503 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHLHE40O14503 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHLHE40O14503 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHLHE40O14503 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHLHE40O14503 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHLHE40O14503 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHLHE40O14503 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHLHE40O14503 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHLHE40O14503 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHLHE40O14503 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHLHE40O14503 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHLHE40O14503 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHLHE40O14503 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHLHE40O14503 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHLHE40O14503 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHLHE40O14503 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHLHE40O14503 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHLHE40O14503 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHLHE40O14503 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHLHE40O14503 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHLHE40O14503 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHLHE40O14503 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
BHLHE40O14503 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHLHE40O14503 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHLHE40O14503 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHLHE40O14503 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
BHLHE40O14503 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHLHE40O14503 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHLHE40O14503 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHLHE40O14503 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHLHE40O14503 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms