Protein–RNA interactions for Protein: O00451

GFRA2, GDNF family receptor alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA2O00451 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GFRA2O00451 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GFRA2O00451 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GFRA2O00451 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GFRA2O00451 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GFRA2O00451 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GFRA2O00451 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GFRA2O00451 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GFRA2O00451 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GFRA2O00451 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GFRA2O00451 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GFRA2O00451 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GFRA2O00451 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GFRA2O00451 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GFRA2O00451 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GFRA2O00451 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GFRA2O00451 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GFRA2O00451 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GFRA2O00451 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GFRA2O00451 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
GFRA2O00451 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GFRA2O00451 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GFRA2O00451 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GFRA2O00451 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GFRA2O00451 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GFRA2O00451 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GFRA2O00451 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC19■□□□□ 0.63
GFRA2O00451 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
GFRA2O00451 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
GFRA2O00451 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
GFRA2O00451 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GFRA2O00451 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GFRA2O00451 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GFRA2O00451 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GFRA2O00451 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GFRA2O00451 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GFRA2O00451 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GFRA2O00451 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GFRA2O00451 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GFRA2O00451 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GFRA2O00451 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GFRA2O00451 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GFRA2O00451 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GFRA2O00451 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GFRA2O00451 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GFRA2O00451 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GFRA2O00451 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GFRA2O00451 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GFRA2O00451 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GFRA2O00451 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GFRA2O00451 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GFRA2O00451 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GFRA2O00451 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GFRA2O00451 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GFRA2O00451 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GFRA2O00451 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GFRA2O00451 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GFRA2O00451 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GFRA2O00451 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GFRA2O00451 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GFRA2O00451 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
GFRA2O00451 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GFRA2O00451 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GFRA2O00451 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GFRA2O00451 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GFRA2O00451 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GFRA2O00451 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GFRA2O00451 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GFRA2O00451 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GFRA2O00451 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GFRA2O00451 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GFRA2O00451 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GFRA2O00451 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GFRA2O00451 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GFRA2O00451 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GFRA2O00451 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GFRA2O00451 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GFRA2O00451 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GFRA2O00451 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GFRA2O00451 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GFRA2O00451 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GFRA2O00451 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
GFRA2O00451 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GFRA2O00451 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GFRA2O00451 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GFRA2O00451 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GFRA2O00451 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
GFRA2O00451 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GFRA2O00451 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
GFRA2O00451 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GFRA2O00451 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GFRA2O00451 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GFRA2O00451 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GFRA2O00451 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GFRA2O00451 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GFRA2O00451 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GFRA2O00451 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GFRA2O00451 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GFRA2O00451 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GFRA2O00451 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms