Protein–RNA interactions for Protein: A6NMT0

DBX1, Homeobox protein DBX1, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DBX1A6NMT0 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DBX1A6NMT0 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DBX1A6NMT0 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DBX1A6NMT0 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DBX1A6NMT0 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DBX1A6NMT0 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DBX1A6NMT0 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DBX1A6NMT0 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DBX1A6NMT0 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DBX1A6NMT0 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DBX1A6NMT0 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DBX1A6NMT0 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DBX1A6NMT0 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DBX1A6NMT0 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DBX1A6NMT0 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DBX1A6NMT0 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DBX1A6NMT0 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DBX1A6NMT0 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DBX1A6NMT0 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DBX1A6NMT0 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DBX1A6NMT0 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DBX1A6NMT0 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DBX1A6NMT0 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DBX1A6NMT0 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DBX1A6NMT0 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DBX1A6NMT0 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DBX1A6NMT0 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DBX1A6NMT0 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DBX1A6NMT0 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DBX1A6NMT0 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DBX1A6NMT0 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DBX1A6NMT0 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DBX1A6NMT0 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DBX1A6NMT0 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DBX1A6NMT0 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DBX1A6NMT0 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DBX1A6NMT0 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DBX1A6NMT0 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DBX1A6NMT0 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DBX1A6NMT0 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DBX1A6NMT0 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DBX1A6NMT0 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DBX1A6NMT0 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DBX1A6NMT0 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DBX1A6NMT0 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DBX1A6NMT0 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DBX1A6NMT0 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DBX1A6NMT0 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DBX1A6NMT0 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DBX1A6NMT0 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DBX1A6NMT0 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DBX1A6NMT0 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DBX1A6NMT0 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DBX1A6NMT0 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DBX1A6NMT0 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DBX1A6NMT0 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DBX1A6NMT0 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DBX1A6NMT0 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DBX1A6NMT0 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DBX1A6NMT0 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DBX1A6NMT0 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DBX1A6NMT0 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DBX1A6NMT0 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DBX1A6NMT0 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DBX1A6NMT0 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DBX1A6NMT0 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DBX1A6NMT0 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DBX1A6NMT0 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DBX1A6NMT0 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DBX1A6NMT0 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DBX1A6NMT0 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DBX1A6NMT0 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DBX1A6NMT0 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DBX1A6NMT0 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DBX1A6NMT0 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DBX1A6NMT0 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DBX1A6NMT0 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DBX1A6NMT0 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DBX1A6NMT0 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DBX1A6NMT0 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DBX1A6NMT0 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DBX1A6NMT0 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DBX1A6NMT0 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DBX1A6NMT0 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DBX1A6NMT0 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DBX1A6NMT0 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DBX1A6NMT0 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DBX1A6NMT0 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DBX1A6NMT0 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DBX1A6NMT0 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DBX1A6NMT0 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DBX1A6NMT0 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DBX1A6NMT0 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DBX1A6NMT0 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DBX1A6NMT0 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DBX1A6NMT0 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DBX1A6NMT0 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DBX1A6NMT0 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DBX1A6NMT0 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DBX1A6NMT0 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms