Protein–RNA interactions for Protein: A6NCQ9

RNF222, RING finger protein 222, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF222A6NCQ9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF222A6NCQ9 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF222A6NCQ9 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF222A6NCQ9 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF222A6NCQ9 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF222A6NCQ9 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF222A6NCQ9 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF222A6NCQ9 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF222A6NCQ9 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF222A6NCQ9 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF222A6NCQ9 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF222A6NCQ9 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF222A6NCQ9 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF222A6NCQ9 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF222A6NCQ9 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF222A6NCQ9 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF222A6NCQ9 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF222A6NCQ9 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF222A6NCQ9 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF222A6NCQ9 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF222A6NCQ9 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF222A6NCQ9 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF222A6NCQ9 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF222A6NCQ9 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF222A6NCQ9 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF222A6NCQ9 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF222A6NCQ9 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF222A6NCQ9 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF222A6NCQ9 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF222A6NCQ9 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF222A6NCQ9 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF222A6NCQ9 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF222A6NCQ9 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF222A6NCQ9 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF222A6NCQ9 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF222A6NCQ9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF222A6NCQ9 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF222A6NCQ9 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF222A6NCQ9 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF222A6NCQ9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF222A6NCQ9 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF222A6NCQ9 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF222A6NCQ9 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF222A6NCQ9 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF222A6NCQ9 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF222A6NCQ9 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF222A6NCQ9 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF222A6NCQ9 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF222A6NCQ9 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF222A6NCQ9 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF222A6NCQ9 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF222A6NCQ9 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF222A6NCQ9 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF222A6NCQ9 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNF222A6NCQ9 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNF222A6NCQ9 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNF222A6NCQ9 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNF222A6NCQ9 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNF222A6NCQ9 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNF222A6NCQ9 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNF222A6NCQ9 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNF222A6NCQ9 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNF222A6NCQ9 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNF222A6NCQ9 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNF222A6NCQ9 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNF222A6NCQ9 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNF222A6NCQ9 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNF222A6NCQ9 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNF222A6NCQ9 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNF222A6NCQ9 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNF222A6NCQ9 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNF222A6NCQ9 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNF222A6NCQ9 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNF222A6NCQ9 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNF222A6NCQ9 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNF222A6NCQ9 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNF222A6NCQ9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNF222A6NCQ9 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNF222A6NCQ9 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNF222A6NCQ9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNF222A6NCQ9 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNF222A6NCQ9 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNF222A6NCQ9 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNF222A6NCQ9 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNF222A6NCQ9 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNF222A6NCQ9 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNF222A6NCQ9 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNF222A6NCQ9 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNF222A6NCQ9 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNF222A6NCQ9 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RNF222A6NCQ9 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNF222A6NCQ9 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNF222A6NCQ9 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNF222A6NCQ9 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNF222A6NCQ9 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNF222A6NCQ9 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNF222A6NCQ9 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNF222A6NCQ9 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RNF222A6NCQ9 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RNF222A6NCQ9 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms