Protein–RNA interactions for Protein: A4D1E1

ZNF804B, Zinc finger protein 804B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF804BA4D1E1 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF804BA4D1E1 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF804BA4D1E1 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF804BA4D1E1 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF804BA4D1E1 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF804BA4D1E1 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF804BA4D1E1 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF804BA4D1E1 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF804BA4D1E1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF804BA4D1E1 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF804BA4D1E1 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF804BA4D1E1 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF804BA4D1E1 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF804BA4D1E1 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF804BA4D1E1 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF804BA4D1E1 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF804BA4D1E1 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF804BA4D1E1 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF804BA4D1E1 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF804BA4D1E1 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF804BA4D1E1 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF804BA4D1E1 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF804BA4D1E1 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF804BA4D1E1 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF804BA4D1E1 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF804BA4D1E1 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF804BA4D1E1 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF804BA4D1E1 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF804BA4D1E1 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF804BA4D1E1 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF804BA4D1E1 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF804BA4D1E1 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF804BA4D1E1 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF804BA4D1E1 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF804BA4D1E1 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF804BA4D1E1 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF804BA4D1E1 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF804BA4D1E1 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF804BA4D1E1 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF804BA4D1E1 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF804BA4D1E1 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF804BA4D1E1 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF804BA4D1E1 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF804BA4D1E1 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF804BA4D1E1 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF804BA4D1E1 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF804BA4D1E1 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF804BA4D1E1 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF804BA4D1E1 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF804BA4D1E1 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF804BA4D1E1 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF804BA4D1E1 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF804BA4D1E1 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF804BA4D1E1 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF804BA4D1E1 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF804BA4D1E1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF804BA4D1E1 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF804BA4D1E1 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF804BA4D1E1 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF804BA4D1E1 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF804BA4D1E1 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF804BA4D1E1 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF804BA4D1E1 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF804BA4D1E1 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF804BA4D1E1 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF804BA4D1E1 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF804BA4D1E1 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF804BA4D1E1 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF804BA4D1E1 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF804BA4D1E1 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF804BA4D1E1 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF804BA4D1E1 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF804BA4D1E1 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF804BA4D1E1 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF804BA4D1E1 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF804BA4D1E1 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF804BA4D1E1 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF804BA4D1E1 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF804BA4D1E1 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF804BA4D1E1 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF804BA4D1E1 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF804BA4D1E1 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF804BA4D1E1 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF804BA4D1E1 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF804BA4D1E1 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF804BA4D1E1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF804BA4D1E1 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF804BA4D1E1 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF804BA4D1E1 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF804BA4D1E1 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF804BA4D1E1 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF804BA4D1E1 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF804BA4D1E1 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF804BA4D1E1 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF804BA4D1E1 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF804BA4D1E1 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF804BA4D1E1 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF804BA4D1E1 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF804BA4D1E1 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF804BA4D1E1 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms