Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y2

NUBP2, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUBP2Q9Y5Y2 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms