Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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SNX13Q9Y5W8 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX13Q9Y5W8 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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SNX13Q9Y5W8 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX13Q9Y5W8 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX13Q9Y5W8 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX13Q9Y5W8 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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SNX13Q9Y5W8 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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SNX13Q9Y5W8 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX13Q9Y5W8 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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SNX13Q9Y5W8 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNX13Q9Y5W8 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNX13Q9Y5W8 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNX13Q9Y5W8 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNX13Q9Y5W8 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SNX13Q9Y5W8 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SNX13Q9Y5W8 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SNX13Q9Y5W8 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNX13Q9Y5W8 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNX13Q9Y5W8 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNX13Q9Y5W8 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNX13Q9Y5W8 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNX13Q9Y5W8 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNX13Q9Y5W8 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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