Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U8

LEMD3, Inner nuclear membrane protein Man1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LEMD3Q9Y2U8 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms