Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS6

SYNPO2, Synaptopodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPO2Q9UMS6 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms