Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMR7

CLEC4A, C-type lectin domain family 4 member A, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4AQ9UMR7 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLEC4AQ9UMR7 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CLEC4AQ9UMR7 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CLEC4AQ9UMR7 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CLEC4AQ9UMR7 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CLEC4AQ9UMR7 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CLEC4AQ9UMR7 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
CLEC4AQ9UMR7 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLEC4AQ9UMR7 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLEC4AQ9UMR7 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLEC4AQ9UMR7 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLEC4AQ9UMR7 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CLEC4AQ9UMR7 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLEC4AQ9UMR7 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLEC4AQ9UMR7 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CLEC4AQ9UMR7 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLEC4AQ9UMR7 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLEC4AQ9UMR7 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLEC4AQ9UMR7 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLEC4AQ9UMR7 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLEC4AQ9UMR7 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLEC4AQ9UMR7 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLEC4AQ9UMR7 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLEC4AQ9UMR7 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CLEC4AQ9UMR7 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLEC4AQ9UMR7 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLEC4AQ9UMR7 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLEC4AQ9UMR7 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLEC4AQ9UMR7 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLEC4AQ9UMR7 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLEC4AQ9UMR7 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLEC4AQ9UMR7 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLEC4AQ9UMR7 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLEC4AQ9UMR7 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLEC4AQ9UMR7 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLEC4AQ9UMR7 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLEC4AQ9UMR7 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLEC4AQ9UMR7 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLEC4AQ9UMR7 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLEC4AQ9UMR7 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLEC4AQ9UMR7 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLEC4AQ9UMR7 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLEC4AQ9UMR7 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLEC4AQ9UMR7 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLEC4AQ9UMR7 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLEC4AQ9UMR7 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLEC4AQ9UMR7 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLEC4AQ9UMR7 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLEC4AQ9UMR7 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLEC4AQ9UMR7 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLEC4AQ9UMR7 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLEC4AQ9UMR7 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLEC4AQ9UMR7 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLEC4AQ9UMR7 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLEC4AQ9UMR7 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLEC4AQ9UMR7 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLEC4AQ9UMR7 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLEC4AQ9UMR7 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLEC4AQ9UMR7 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLEC4AQ9UMR7 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLEC4AQ9UMR7 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLEC4AQ9UMR7 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLEC4AQ9UMR7 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLEC4AQ9UMR7 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLEC4AQ9UMR7 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CLEC4AQ9UMR7 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLEC4AQ9UMR7 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CLEC4AQ9UMR7 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLEC4AQ9UMR7 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLEC4AQ9UMR7 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLEC4AQ9UMR7 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLEC4AQ9UMR7 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLEC4AQ9UMR7 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLEC4AQ9UMR7 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLEC4AQ9UMR7 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLEC4AQ9UMR7 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLEC4AQ9UMR7 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLEC4AQ9UMR7 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLEC4AQ9UMR7 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLEC4AQ9UMR7 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CLEC4AQ9UMR7 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLEC4AQ9UMR7 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLEC4AQ9UMR7 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLEC4AQ9UMR7 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLEC4AQ9UMR7 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLEC4AQ9UMR7 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLEC4AQ9UMR7 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLEC4AQ9UMR7 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLEC4AQ9UMR7 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLEC4AQ9UMR7 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLEC4AQ9UMR7 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLEC4AQ9UMR7 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLEC4AQ9UMR7 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLEC4AQ9UMR7 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLEC4AQ9UMR7 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLEC4AQ9UMR7 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLEC4AQ9UMR7 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLEC4AQ9UMR7 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLEC4AQ9UMR7 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLEC4AQ9UMR7 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms