Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB1

NRXN1, Neurexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1Q9ULB1 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
NRXN1Q9ULB1 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NRXN1Q9ULB1 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NRXN1Q9ULB1 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NRXN1Q9ULB1 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NRXN1Q9ULB1 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NRXN1Q9ULB1 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NRXN1Q9ULB1 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NRXN1Q9ULB1 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NRXN1Q9ULB1 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NRXN1Q9ULB1 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NRXN1Q9ULB1 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NRXN1Q9ULB1 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NRXN1Q9ULB1 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
NRXN1Q9ULB1 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NRXN1Q9ULB1 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NRXN1Q9ULB1 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NRXN1Q9ULB1 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NRXN1Q9ULB1 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NRXN1Q9ULB1 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NRXN1Q9ULB1 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NRXN1Q9ULB1 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NRXN1Q9ULB1 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NRXN1Q9ULB1 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
NRXN1Q9ULB1 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NRXN1Q9ULB1 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NRXN1Q9ULB1 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NRXN1Q9ULB1 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NRXN1Q9ULB1 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NRXN1Q9ULB1 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NRXN1Q9ULB1 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NRXN1Q9ULB1 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NRXN1Q9ULB1 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
NRXN1Q9ULB1 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NRXN1Q9ULB1 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
NRXN1Q9ULB1 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NRXN1Q9ULB1 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NRXN1Q9ULB1 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NRXN1Q9ULB1 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NRXN1Q9ULB1 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NRXN1Q9ULB1 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NRXN1Q9ULB1 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NRXN1Q9ULB1 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NRXN1Q9ULB1 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NRXN1Q9ULB1 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
NRXN1Q9ULB1 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NRXN1Q9ULB1 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NRXN1Q9ULB1 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NRXN1Q9ULB1 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NRXN1Q9ULB1 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NRXN1Q9ULB1 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
NRXN1Q9ULB1 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
NRXN1Q9ULB1 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NRXN1Q9ULB1 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NRXN1Q9ULB1 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NRXN1Q9ULB1 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NRXN1Q9ULB1 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NRXN1Q9ULB1 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
NRXN1Q9ULB1 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NRXN1Q9ULB1 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NRXN1Q9ULB1 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
NRXN1Q9ULB1 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
NRXN1Q9ULB1 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
NRXN1Q9ULB1 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NRXN1Q9ULB1 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NRXN1Q9ULB1 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NRXN1Q9ULB1 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NRXN1Q9ULB1 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NRXN1Q9ULB1 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NRXN1Q9ULB1 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NRXN1Q9ULB1 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NRXN1Q9ULB1 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NRXN1Q9ULB1 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NRXN1Q9ULB1 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
NRXN1Q9ULB1 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
NRXN1Q9ULB1 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NRXN1Q9ULB1 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NRXN1Q9ULB1 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NRXN1Q9ULB1 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NRXN1Q9ULB1 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NRXN1Q9ULB1 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NRXN1Q9ULB1 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NRXN1Q9ULB1 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NRXN1Q9ULB1 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NRXN1Q9ULB1 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NRXN1Q9ULB1 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
NRXN1Q9ULB1 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
NRXN1Q9ULB1 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NRXN1Q9ULB1 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NRXN1Q9ULB1 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NRXN1Q9ULB1 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NRXN1Q9ULB1 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NRXN1Q9ULB1 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NRXN1Q9ULB1 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NRXN1Q9ULB1 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NRXN1Q9ULB1 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NRXN1Q9ULB1 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NRXN1Q9ULB1 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
NRXN1Q9ULB1 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NRXN1Q9ULB1 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms