Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms