Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SCN11AQ9UI33 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SCN11AQ9UI33 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCN11AQ9UI33 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCN11AQ9UI33 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCN11AQ9UI33 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SCN11AQ9UI33 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SCN11AQ9UI33 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SCN11AQ9UI33 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCN11AQ9UI33 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCN11AQ9UI33 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCN11AQ9UI33 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCN11AQ9UI33 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCN11AQ9UI33 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCN11AQ9UI33 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SCN11AQ9UI33 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCN11AQ9UI33 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCN11AQ9UI33 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SCN11AQ9UI33 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SCN11AQ9UI33 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCN11AQ9UI33 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCN11AQ9UI33 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCN11AQ9UI33 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SCN11AQ9UI33 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCN11AQ9UI33 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCN11AQ9UI33 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCN11AQ9UI33 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCN11AQ9UI33 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCN11AQ9UI33 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCN11AQ9UI33 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCN11AQ9UI33 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCN11AQ9UI33 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCN11AQ9UI33 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCN11AQ9UI33 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCN11AQ9UI33 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SCN11AQ9UI33 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCN11AQ9UI33 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SCN11AQ9UI33 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCN11AQ9UI33 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SCN11AQ9UI33 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCN11AQ9UI33 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCN11AQ9UI33 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCN11AQ9UI33 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCN11AQ9UI33 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCN11AQ9UI33 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCN11AQ9UI33 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCN11AQ9UI33 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCN11AQ9UI33 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCN11AQ9UI33 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCN11AQ9UI33 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SCN11AQ9UI33 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SCN11AQ9UI33 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCN11AQ9UI33 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCN11AQ9UI33 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SCN11AQ9UI33 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCN11AQ9UI33 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCN11AQ9UI33 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCN11AQ9UI33 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCN11AQ9UI33 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCN11AQ9UI33 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCN11AQ9UI33 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SCN11AQ9UI33 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCN11AQ9UI33 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCN11AQ9UI33 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCN11AQ9UI33 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCN11AQ9UI33 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCN11AQ9UI33 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCN11AQ9UI33 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCN11AQ9UI33 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCN11AQ9UI33 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SCN11AQ9UI33 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCN11AQ9UI33 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCN11AQ9UI33 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCN11AQ9UI33 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SCN11AQ9UI33 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCN11AQ9UI33 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCN11AQ9UI33 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCN11AQ9UI33 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCN11AQ9UI33 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCN11AQ9UI33 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCN11AQ9UI33 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCN11AQ9UI33 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCN11AQ9UI33 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCN11AQ9UI33 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SCN11AQ9UI33 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SCN11AQ9UI33 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCN11AQ9UI33 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCN11AQ9UI33 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCN11AQ9UI33 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCN11AQ9UI33 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCN11AQ9UI33 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCN11AQ9UI33 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCN11AQ9UI33 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCN11AQ9UI33 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCN11AQ9UI33 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCN11AQ9UI33 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCN11AQ9UI33 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SCN11AQ9UI33 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCN11AQ9UI33 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCN11AQ9UI33 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms