Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY8

CLN8, Protein CLN8, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8Q9UBY8 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms