Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms