Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms