Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 353.2 ms