Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG8

KCNK4, Potassium channel subfamily K member 4, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK4Q9NYG8 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNK4Q9NYG8 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNK4Q9NYG8 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNK4Q9NYG8 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNK4Q9NYG8 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNK4Q9NYG8 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNK4Q9NYG8 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNK4Q9NYG8 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNK4Q9NYG8 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNK4Q9NYG8 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNK4Q9NYG8 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNK4Q9NYG8 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNK4Q9NYG8 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNK4Q9NYG8 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNK4Q9NYG8 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNK4Q9NYG8 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNK4Q9NYG8 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNK4Q9NYG8 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNK4Q9NYG8 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNK4Q9NYG8 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNK4Q9NYG8 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNK4Q9NYG8 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNK4Q9NYG8 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNK4Q9NYG8 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNK4Q9NYG8 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNK4Q9NYG8 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNK4Q9NYG8 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNK4Q9NYG8 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNK4Q9NYG8 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNK4Q9NYG8 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNK4Q9NYG8 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNK4Q9NYG8 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNK4Q9NYG8 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNK4Q9NYG8 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNK4Q9NYG8 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNK4Q9NYG8 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNK4Q9NYG8 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNK4Q9NYG8 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNK4Q9NYG8 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNK4Q9NYG8 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNK4Q9NYG8 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNK4Q9NYG8 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNK4Q9NYG8 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNK4Q9NYG8 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNK4Q9NYG8 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNK4Q9NYG8 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNK4Q9NYG8 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNK4Q9NYG8 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNK4Q9NYG8 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNK4Q9NYG8 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNK4Q9NYG8 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNK4Q9NYG8 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNK4Q9NYG8 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNK4Q9NYG8 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNK4Q9NYG8 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNK4Q9NYG8 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNK4Q9NYG8 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNK4Q9NYG8 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNK4Q9NYG8 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNK4Q9NYG8 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNK4Q9NYG8 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNK4Q9NYG8 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNK4Q9NYG8 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNK4Q9NYG8 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNK4Q9NYG8 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNK4Q9NYG8 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNK4Q9NYG8 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNK4Q9NYG8 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNK4Q9NYG8 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNK4Q9NYG8 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNK4Q9NYG8 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNK4Q9NYG8 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNK4Q9NYG8 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNK4Q9NYG8 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNK4Q9NYG8 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNK4Q9NYG8 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNK4Q9NYG8 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNK4Q9NYG8 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNK4Q9NYG8 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNK4Q9NYG8 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNK4Q9NYG8 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNK4Q9NYG8 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNK4Q9NYG8 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNK4Q9NYG8 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNK4Q9NYG8 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNK4Q9NYG8 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNK4Q9NYG8 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNK4Q9NYG8 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNK4Q9NYG8 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNK4Q9NYG8 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNK4Q9NYG8 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNK4Q9NYG8 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNK4Q9NYG8 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNK4Q9NYG8 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNK4Q9NYG8 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNK4Q9NYG8 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNK4Q9NYG8 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNK4Q9NYG8 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNK4Q9NYG8 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNK4Q9NYG8 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms