Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ0

MS4A12, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A12Q9NXJ0 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MS4A12Q9NXJ0 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms