Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI1

FANCI, Fanconi anemia group I protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCIQ9NVI1 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
FANCIQ9NVI1 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FANCIQ9NVI1 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FANCIQ9NVI1 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FANCIQ9NVI1 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FANCIQ9NVI1 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FANCIQ9NVI1 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FANCIQ9NVI1 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FANCIQ9NVI1 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FANCIQ9NVI1 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
FANCIQ9NVI1 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FANCIQ9NVI1 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FANCIQ9NVI1 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FANCIQ9NVI1 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FANCIQ9NVI1 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FANCIQ9NVI1 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FANCIQ9NVI1 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
FANCIQ9NVI1 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FANCIQ9NVI1 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FANCIQ9NVI1 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FANCIQ9NVI1 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FANCIQ9NVI1 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FANCIQ9NVI1 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FANCIQ9NVI1 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FANCIQ9NVI1 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FANCIQ9NVI1 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FANCIQ9NVI1 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FANCIQ9NVI1 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FANCIQ9NVI1 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FANCIQ9NVI1 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FANCIQ9NVI1 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FANCIQ9NVI1 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FANCIQ9NVI1 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FANCIQ9NVI1 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FANCIQ9NVI1 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
FANCIQ9NVI1 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
FANCIQ9NVI1 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
FANCIQ9NVI1 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
FANCIQ9NVI1 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FANCIQ9NVI1 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FANCIQ9NVI1 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FANCIQ9NVI1 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FANCIQ9NVI1 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
FANCIQ9NVI1 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FANCIQ9NVI1 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FANCIQ9NVI1 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FANCIQ9NVI1 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FANCIQ9NVI1 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FANCIQ9NVI1 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FANCIQ9NVI1 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FANCIQ9NVI1 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
FANCIQ9NVI1 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
FANCIQ9NVI1 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
FANCIQ9NVI1 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
FANCIQ9NVI1 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
FANCIQ9NVI1 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
FANCIQ9NVI1 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
FANCIQ9NVI1 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
FANCIQ9NVI1 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
FANCIQ9NVI1 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
FANCIQ9NVI1 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FANCIQ9NVI1 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FANCIQ9NVI1 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FANCIQ9NVI1 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FANCIQ9NVI1 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FANCIQ9NVI1 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FANCIQ9NVI1 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FANCIQ9NVI1 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FANCIQ9NVI1 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
FANCIQ9NVI1 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FANCIQ9NVI1 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FANCIQ9NVI1 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FANCIQ9NVI1 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FANCIQ9NVI1 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FANCIQ9NVI1 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
FANCIQ9NVI1 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FANCIQ9NVI1 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FANCIQ9NVI1 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
FANCIQ9NVI1 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FANCIQ9NVI1 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FANCIQ9NVI1 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FANCIQ9NVI1 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FANCIQ9NVI1 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FANCIQ9NVI1 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FANCIQ9NVI1 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FANCIQ9NVI1 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FANCIQ9NVI1 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FANCIQ9NVI1 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
FANCIQ9NVI1 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FANCIQ9NVI1 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FANCIQ9NVI1 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FANCIQ9NVI1 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FANCIQ9NVI1 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FANCIQ9NVI1 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FANCIQ9NVI1 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FANCIQ9NVI1 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FANCIQ9NVI1 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FANCIQ9NVI1 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FANCIQ9NVI1 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FANCIQ9NVI1 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms