Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms