Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms