Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
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RAB9BQ9NP90 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
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RAB9BQ9NP90 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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