Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP87

POLM, DNA-directed DNA/RNA polymerase mu, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLMQ9NP87 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLMQ9NP87 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLMQ9NP87 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLMQ9NP87 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLMQ9NP87 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLMQ9NP87 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLMQ9NP87 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLMQ9NP87 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLMQ9NP87 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLMQ9NP87 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLMQ9NP87 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
POLMQ9NP87 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLMQ9NP87 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLMQ9NP87 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLMQ9NP87 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLMQ9NP87 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLMQ9NP87 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLMQ9NP87 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLMQ9NP87 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLMQ9NP87 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLMQ9NP87 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
POLMQ9NP87 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLMQ9NP87 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLMQ9NP87 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLMQ9NP87 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLMQ9NP87 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLMQ9NP87 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLMQ9NP87 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLMQ9NP87 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLMQ9NP87 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLMQ9NP87 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLMQ9NP87 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLMQ9NP87 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLMQ9NP87 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLMQ9NP87 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLMQ9NP87 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLMQ9NP87 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLMQ9NP87 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLMQ9NP87 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLMQ9NP87 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLMQ9NP87 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLMQ9NP87 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLMQ9NP87 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLMQ9NP87 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLMQ9NP87 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
POLMQ9NP87 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLMQ9NP87 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLMQ9NP87 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
POLMQ9NP87 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLMQ9NP87 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLMQ9NP87 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLMQ9NP87 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLMQ9NP87 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLMQ9NP87 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLMQ9NP87 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLMQ9NP87 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLMQ9NP87 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLMQ9NP87 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLMQ9NP87 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLMQ9NP87 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLMQ9NP87 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLMQ9NP87 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLMQ9NP87 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLMQ9NP87 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
POLMQ9NP87 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLMQ9NP87 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLMQ9NP87 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLMQ9NP87 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLMQ9NP87 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLMQ9NP87 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLMQ9NP87 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLMQ9NP87 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLMQ9NP87 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLMQ9NP87 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
POLMQ9NP87 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
POLMQ9NP87 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLMQ9NP87 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLMQ9NP87 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLMQ9NP87 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLMQ9NP87 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLMQ9NP87 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLMQ9NP87 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLMQ9NP87 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
POLMQ9NP87 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLMQ9NP87 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLMQ9NP87 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLMQ9NP87 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLMQ9NP87 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLMQ9NP87 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLMQ9NP87 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLMQ9NP87 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLMQ9NP87 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLMQ9NP87 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLMQ9NP87 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLMQ9NP87 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLMQ9NP87 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
POLMQ9NP87 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLMQ9NP87 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLMQ9NP87 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
POLMQ9NP87 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms