Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC90BQ9GZT6 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms