Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM54Q9BYV2 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms