Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE9

CDHR2, Cadherin-related family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDHR2Q9BYE9 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDHR2Q9BYE9 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDHR2Q9BYE9 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDHR2Q9BYE9 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
CDHR2Q9BYE9 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDHR2Q9BYE9 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDHR2Q9BYE9 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDHR2Q9BYE9 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
CDHR2Q9BYE9 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
CDHR2Q9BYE9 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDHR2Q9BYE9 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDHR2Q9BYE9 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDHR2Q9BYE9 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDHR2Q9BYE9 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDHR2Q9BYE9 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDHR2Q9BYE9 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDHR2Q9BYE9 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDHR2Q9BYE9 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDHR2Q9BYE9 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDHR2Q9BYE9 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDHR2Q9BYE9 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDHR2Q9BYE9 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDHR2Q9BYE9 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDHR2Q9BYE9 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDHR2Q9BYE9 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDHR2Q9BYE9 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDHR2Q9BYE9 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDHR2Q9BYE9 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDHR2Q9BYE9 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDHR2Q9BYE9 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDHR2Q9BYE9 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDHR2Q9BYE9 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDHR2Q9BYE9 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDHR2Q9BYE9 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CDHR2Q9BYE9 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDHR2Q9BYE9 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDHR2Q9BYE9 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDHR2Q9BYE9 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDHR2Q9BYE9 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDHR2Q9BYE9 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDHR2Q9BYE9 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDHR2Q9BYE9 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDHR2Q9BYE9 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDHR2Q9BYE9 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDHR2Q9BYE9 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDHR2Q9BYE9 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDHR2Q9BYE9 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDHR2Q9BYE9 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDHR2Q9BYE9 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CDHR2Q9BYE9 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDHR2Q9BYE9 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDHR2Q9BYE9 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDHR2Q9BYE9 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDHR2Q9BYE9 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CDHR2Q9BYE9 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDHR2Q9BYE9 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDHR2Q9BYE9 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CDHR2Q9BYE9 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDHR2Q9BYE9 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDHR2Q9BYE9 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDHR2Q9BYE9 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDHR2Q9BYE9 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDHR2Q9BYE9 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDHR2Q9BYE9 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDHR2Q9BYE9 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDHR2Q9BYE9 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDHR2Q9BYE9 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDHR2Q9BYE9 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDHR2Q9BYE9 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDHR2Q9BYE9 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDHR2Q9BYE9 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDHR2Q9BYE9 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDHR2Q9BYE9 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDHR2Q9BYE9 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDHR2Q9BYE9 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDHR2Q9BYE9 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDHR2Q9BYE9 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDHR2Q9BYE9 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDHR2Q9BYE9 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDHR2Q9BYE9 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDHR2Q9BYE9 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDHR2Q9BYE9 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDHR2Q9BYE9 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDHR2Q9BYE9 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDHR2Q9BYE9 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDHR2Q9BYE9 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDHR2Q9BYE9 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDHR2Q9BYE9 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDHR2Q9BYE9 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDHR2Q9BYE9 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDHR2Q9BYE9 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDHR2Q9BYE9 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDHR2Q9BYE9 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDHR2Q9BYE9 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDHR2Q9BYE9 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDHR2Q9BYE9 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDHR2Q9BYE9 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDHR2Q9BYE9 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDHR2Q9BYE9 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDHR2Q9BYE9 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms