Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 212.1 ms