Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTM1

H2AFJ, Histone H2A.J, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFJQ9BTM1 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2AFJQ9BTM1 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2AFJQ9BTM1 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
H2AFJQ9BTM1 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2AFJQ9BTM1 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2AFJQ9BTM1 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2AFJQ9BTM1 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2AFJQ9BTM1 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
H2AFJQ9BTM1 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2AFJQ9BTM1 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2AFJQ9BTM1 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2AFJQ9BTM1 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2AFJQ9BTM1 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2AFJQ9BTM1 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2AFJQ9BTM1 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2AFJQ9BTM1 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2AFJQ9BTM1 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2AFJQ9BTM1 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2AFJQ9BTM1 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2AFJQ9BTM1 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2AFJQ9BTM1 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2AFJQ9BTM1 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2AFJQ9BTM1 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
H2AFJQ9BTM1 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2AFJQ9BTM1 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2AFJQ9BTM1 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2AFJQ9BTM1 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2AFJQ9BTM1 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2AFJQ9BTM1 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2AFJQ9BTM1 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2AFJQ9BTM1 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2AFJQ9BTM1 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2AFJQ9BTM1 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2AFJQ9BTM1 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2AFJQ9BTM1 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2AFJQ9BTM1 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2AFJQ9BTM1 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2AFJQ9BTM1 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2AFJQ9BTM1 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
H2AFJQ9BTM1 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2AFJQ9BTM1 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2AFJQ9BTM1 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2AFJQ9BTM1 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2AFJQ9BTM1 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2AFJQ9BTM1 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2AFJQ9BTM1 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2AFJQ9BTM1 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2AFJQ9BTM1 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2AFJQ9BTM1 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2AFJQ9BTM1 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2AFJQ9BTM1 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2AFJQ9BTM1 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2AFJQ9BTM1 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2AFJQ9BTM1 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2AFJQ9BTM1 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2AFJQ9BTM1 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2AFJQ9BTM1 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2AFJQ9BTM1 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2AFJQ9BTM1 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
H2AFJQ9BTM1 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2AFJQ9BTM1 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2AFJQ9BTM1 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2AFJQ9BTM1 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2AFJQ9BTM1 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2AFJQ9BTM1 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2AFJQ9BTM1 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
H2AFJQ9BTM1 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2AFJQ9BTM1 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2AFJQ9BTM1 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2AFJQ9BTM1 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2AFJQ9BTM1 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2AFJQ9BTM1 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2AFJQ9BTM1 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2AFJQ9BTM1 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2AFJQ9BTM1 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
H2AFJQ9BTM1 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2AFJQ9BTM1 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
H2AFJQ9BTM1 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
H2AFJQ9BTM1 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
H2AFJQ9BTM1 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2AFJQ9BTM1 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2AFJQ9BTM1 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2AFJQ9BTM1 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2AFJQ9BTM1 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2AFJQ9BTM1 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2AFJQ9BTM1 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2AFJQ9BTM1 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2AFJQ9BTM1 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2AFJQ9BTM1 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2AFJQ9BTM1 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
H2AFJQ9BTM1 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2AFJQ9BTM1 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2AFJQ9BTM1 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2AFJQ9BTM1 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2AFJQ9BTM1 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2AFJQ9BTM1 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2AFJQ9BTM1 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2AFJQ9BTM1 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2AFJQ9BTM1 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2AFJQ9BTM1 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms