Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms