Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSM1

PCGF1, Polycomb group RING finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF1Q9BSM1 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms