Protein–RNA interactions for Protein: Q99928

GABRG3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit gamma-3, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRG3Q99928 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GABRG3Q99928 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GABRG3Q99928 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GABRG3Q99928 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GABRG3Q99928 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GABRG3Q99928 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GABRG3Q99928 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GABRG3Q99928 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABRG3Q99928 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABRG3Q99928 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABRG3Q99928 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GABRG3Q99928 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABRG3Q99928 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABRG3Q99928 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABRG3Q99928 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABRG3Q99928 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABRG3Q99928 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABRG3Q99928 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABRG3Q99928 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABRG3Q99928 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GABRG3Q99928 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABRG3Q99928 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABRG3Q99928 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABRG3Q99928 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABRG3Q99928 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABRG3Q99928 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABRG3Q99928 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABRG3Q99928 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABRG3Q99928 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABRG3Q99928 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABRG3Q99928 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABRG3Q99928 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABRG3Q99928 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GABRG3Q99928 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABRG3Q99928 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABRG3Q99928 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABRG3Q99928 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABRG3Q99928 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABRG3Q99928 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABRG3Q99928 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABRG3Q99928 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABRG3Q99928 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABRG3Q99928 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABRG3Q99928 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABRG3Q99928 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABRG3Q99928 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABRG3Q99928 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABRG3Q99928 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABRG3Q99928 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GABRG3Q99928 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GABRG3Q99928 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GABRG3Q99928 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GABRG3Q99928 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABRG3Q99928 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABRG3Q99928 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABRG3Q99928 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABRG3Q99928 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABRG3Q99928 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABRG3Q99928 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GABRG3Q99928 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GABRG3Q99928 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GABRG3Q99928 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
GABRG3Q99928 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GABRG3Q99928 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GABRG3Q99928 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GABRG3Q99928 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GABRG3Q99928 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GABRG3Q99928 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GABRG3Q99928 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GABRG3Q99928 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GABRG3Q99928 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GABRG3Q99928 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GABRG3Q99928 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GABRG3Q99928 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GABRG3Q99928 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GABRG3Q99928 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GABRG3Q99928 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GABRG3Q99928 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GABRG3Q99928 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GABRG3Q99928 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GABRG3Q99928 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GABRG3Q99928 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GABRG3Q99928 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GABRG3Q99928 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GABRG3Q99928 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GABRG3Q99928 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GABRG3Q99928 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GABRG3Q99928 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GABRG3Q99928 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GABRG3Q99928 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GABRG3Q99928 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GABRG3Q99928 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GABRG3Q99928 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABRG3Q99928 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABRG3Q99928 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABRG3Q99928 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABRG3Q99928 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABRG3Q99928 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABRG3Q99928 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABRG3Q99928 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms