Protein–RNA interactions for Protein: Q99523

SORT1, Sortilin, humanhuman

Predictions only

Length 831 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORT1Q99523 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SORT1Q99523 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SORT1Q99523 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SORT1Q99523 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SORT1Q99523 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SORT1Q99523 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SORT1Q99523 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SORT1Q99523 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SORT1Q99523 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SORT1Q99523 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SORT1Q99523 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SORT1Q99523 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SORT1Q99523 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SORT1Q99523 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SORT1Q99523 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SORT1Q99523 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SORT1Q99523 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SORT1Q99523 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SORT1Q99523 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SORT1Q99523 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SORT1Q99523 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SORT1Q99523 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SORT1Q99523 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SORT1Q99523 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SORT1Q99523 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SORT1Q99523 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SORT1Q99523 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SORT1Q99523 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SORT1Q99523 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SORT1Q99523 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SORT1Q99523 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SORT1Q99523 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SORT1Q99523 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SORT1Q99523 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SORT1Q99523 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SORT1Q99523 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SORT1Q99523 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SORT1Q99523 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SORT1Q99523 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SORT1Q99523 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SORT1Q99523 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SORT1Q99523 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SORT1Q99523 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SORT1Q99523 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SORT1Q99523 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SORT1Q99523 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SORT1Q99523 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SORT1Q99523 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SORT1Q99523 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SORT1Q99523 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SORT1Q99523 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SORT1Q99523 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SORT1Q99523 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SORT1Q99523 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SORT1Q99523 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SORT1Q99523 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SORT1Q99523 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SORT1Q99523 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SORT1Q99523 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SORT1Q99523 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SORT1Q99523 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SORT1Q99523 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SORT1Q99523 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SORT1Q99523 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SORT1Q99523 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SORT1Q99523 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SORT1Q99523 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SORT1Q99523 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SORT1Q99523 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SORT1Q99523 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SORT1Q99523 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SORT1Q99523 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SORT1Q99523 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SORT1Q99523 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SORT1Q99523 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SORT1Q99523 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SORT1Q99523 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SORT1Q99523 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SORT1Q99523 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SORT1Q99523 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SORT1Q99523 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SORT1Q99523 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SORT1Q99523 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SORT1Q99523 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SORT1Q99523 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SORT1Q99523 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SORT1Q99523 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SORT1Q99523 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SORT1Q99523 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SORT1Q99523 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SORT1Q99523 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SORT1Q99523 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SORT1Q99523 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SORT1Q99523 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SORT1Q99523 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SORT1Q99523 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SORT1Q99523 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SORT1Q99523 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SORT1Q99523 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SORT1Q99523 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms