Protein–RNA interactions for Protein: Q96RJ3

TNFRSF13C, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF13CQ96RJ3 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TNFRSF13CQ96RJ3 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TNFRSF13CQ96RJ3 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TNFRSF13CQ96RJ3 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TNFRSF13CQ96RJ3 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TNFRSF13CQ96RJ3 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TNFRSF13CQ96RJ3 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TNFRSF13CQ96RJ3 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TNFRSF13CQ96RJ3 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
TNFRSF13CQ96RJ3 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TNFRSF13CQ96RJ3 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TNFRSF13CQ96RJ3 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TNFRSF13CQ96RJ3 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TNFRSF13CQ96RJ3 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TNFRSF13CQ96RJ3 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TNFRSF13CQ96RJ3 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TNFRSF13CQ96RJ3 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TNFRSF13CQ96RJ3 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TNFRSF13CQ96RJ3 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TNFRSF13CQ96RJ3 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TNFRSF13CQ96RJ3 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TNFRSF13CQ96RJ3 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TNFRSF13CQ96RJ3 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TNFRSF13CQ96RJ3 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TNFRSF13CQ96RJ3 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TNFRSF13CQ96RJ3 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TNFRSF13CQ96RJ3 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TNFRSF13CQ96RJ3 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TNFRSF13CQ96RJ3 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TNFRSF13CQ96RJ3 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TNFRSF13CQ96RJ3 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TNFRSF13CQ96RJ3 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TNFRSF13CQ96RJ3 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TNFRSF13CQ96RJ3 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TNFRSF13CQ96RJ3 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TNFRSF13CQ96RJ3 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TNFRSF13CQ96RJ3 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TNFRSF13CQ96RJ3 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TNFRSF13CQ96RJ3 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TNFRSF13CQ96RJ3 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TNFRSF13CQ96RJ3 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TNFRSF13CQ96RJ3 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TNFRSF13CQ96RJ3 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TNFRSF13CQ96RJ3 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TNFRSF13CQ96RJ3 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TNFRSF13CQ96RJ3 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TNFRSF13CQ96RJ3 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TNFRSF13CQ96RJ3 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TNFRSF13CQ96RJ3 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TNFRSF13CQ96RJ3 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TNFRSF13CQ96RJ3 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TNFRSF13CQ96RJ3 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TNFRSF13CQ96RJ3 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TNFRSF13CQ96RJ3 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TNFRSF13CQ96RJ3 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms