Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms