Protein–RNA interactions for Protein: Q96MU7

YTHDC1, YTH domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDC1Q96MU7 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
YTHDC1Q96MU7 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
YTHDC1Q96MU7 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
YTHDC1Q96MU7 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
YTHDC1Q96MU7 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
YTHDC1Q96MU7 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
YTHDC1Q96MU7 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
YTHDC1Q96MU7 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
YTHDC1Q96MU7 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
YTHDC1Q96MU7 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
YTHDC1Q96MU7 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
YTHDC1Q96MU7 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
YTHDC1Q96MU7 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
YTHDC1Q96MU7 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
YTHDC1Q96MU7 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
YTHDC1Q96MU7 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
YTHDC1Q96MU7 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
YTHDC1Q96MU7 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms