Protein–RNA interactions for Protein: Q96HR3

MED30, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 30, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED30Q96HR3 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MED30Q96HR3 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MED30Q96HR3 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MED30Q96HR3 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MED30Q96HR3 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MED30Q96HR3 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MED30Q96HR3 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MED30Q96HR3 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MED30Q96HR3 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MED30Q96HR3 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MED30Q96HR3 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MED30Q96HR3 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MED30Q96HR3 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED30Q96HR3 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED30Q96HR3 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED30Q96HR3 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED30Q96HR3 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED30Q96HR3 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED30Q96HR3 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED30Q96HR3 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED30Q96HR3 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED30Q96HR3 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED30Q96HR3 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED30Q96HR3 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MED30Q96HR3 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED30Q96HR3 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED30Q96HR3 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED30Q96HR3 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED30Q96HR3 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED30Q96HR3 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MED30Q96HR3 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED30Q96HR3 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED30Q96HR3 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MED30Q96HR3 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED30Q96HR3 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED30Q96HR3 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED30Q96HR3 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED30Q96HR3 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED30Q96HR3 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED30Q96HR3 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED30Q96HR3 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED30Q96HR3 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED30Q96HR3 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED30Q96HR3 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED30Q96HR3 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED30Q96HR3 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MED30Q96HR3 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED30Q96HR3 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED30Q96HR3 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED30Q96HR3 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED30Q96HR3 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED30Q96HR3 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED30Q96HR3 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED30Q96HR3 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED30Q96HR3 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED30Q96HR3 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED30Q96HR3 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED30Q96HR3 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED30Q96HR3 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED30Q96HR3 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED30Q96HR3 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED30Q96HR3 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED30Q96HR3 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED30Q96HR3 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED30Q96HR3 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED30Q96HR3 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED30Q96HR3 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED30Q96HR3 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED30Q96HR3 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED30Q96HR3 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED30Q96HR3 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED30Q96HR3 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED30Q96HR3 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED30Q96HR3 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED30Q96HR3 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED30Q96HR3 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED30Q96HR3 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED30Q96HR3 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED30Q96HR3 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED30Q96HR3 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MED30Q96HR3 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED30Q96HR3 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED30Q96HR3 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED30Q96HR3 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED30Q96HR3 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED30Q96HR3 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MED30Q96HR3 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED30Q96HR3 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED30Q96HR3 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED30Q96HR3 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED30Q96HR3 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED30Q96HR3 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED30Q96HR3 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED30Q96HR3 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED30Q96HR3 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED30Q96HR3 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED30Q96HR3 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED30Q96HR3 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED30Q96HR3 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED30Q96HR3 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms