Protein–RNA interactions for Protein: Q96G28

CFAP36, Cilia- and flagella-associated protein 36, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP36Q96G28 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CFAP36Q96G28 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CFAP36Q96G28 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CFAP36Q96G28 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CFAP36Q96G28 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CFAP36Q96G28 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CFAP36Q96G28 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CFAP36Q96G28 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CFAP36Q96G28 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CFAP36Q96G28 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CFAP36Q96G28 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CFAP36Q96G28 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CFAP36Q96G28 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CFAP36Q96G28 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CFAP36Q96G28 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CFAP36Q96G28 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CFAP36Q96G28 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CFAP36Q96G28 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CFAP36Q96G28 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CFAP36Q96G28 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CFAP36Q96G28 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CFAP36Q96G28 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CFAP36Q96G28 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CFAP36Q96G28 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CFAP36Q96G28 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CFAP36Q96G28 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CFAP36Q96G28 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CFAP36Q96G28 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CFAP36Q96G28 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CFAP36Q96G28 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CFAP36Q96G28 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CFAP36Q96G28 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CFAP36Q96G28 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CFAP36Q96G28 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CFAP36Q96G28 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CFAP36Q96G28 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CFAP36Q96G28 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CFAP36Q96G28 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CFAP36Q96G28 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CFAP36Q96G28 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CFAP36Q96G28 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CFAP36Q96G28 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CFAP36Q96G28 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CFAP36Q96G28 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CFAP36Q96G28 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CFAP36Q96G28 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CFAP36Q96G28 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CFAP36Q96G28 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CFAP36Q96G28 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CFAP36Q96G28 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CFAP36Q96G28 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CFAP36Q96G28 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CFAP36Q96G28 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CFAP36Q96G28 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CFAP36Q96G28 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CFAP36Q96G28 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CFAP36Q96G28 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CFAP36Q96G28 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CFAP36Q96G28 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CFAP36Q96G28 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CFAP36Q96G28 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CFAP36Q96G28 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CFAP36Q96G28 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CFAP36Q96G28 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CFAP36Q96G28 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CFAP36Q96G28 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CFAP36Q96G28 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CFAP36Q96G28 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CFAP36Q96G28 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CFAP36Q96G28 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CFAP36Q96G28 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CFAP36Q96G28 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CFAP36Q96G28 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CFAP36Q96G28 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CFAP36Q96G28 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CFAP36Q96G28 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CFAP36Q96G28 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CFAP36Q96G28 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CFAP36Q96G28 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CFAP36Q96G28 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CFAP36Q96G28 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CFAP36Q96G28 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CFAP36Q96G28 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CFAP36Q96G28 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CFAP36Q96G28 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CFAP36Q96G28 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CFAP36Q96G28 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CFAP36Q96G28 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CFAP36Q96G28 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CFAP36Q96G28 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CFAP36Q96G28 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CFAP36Q96G28 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CFAP36Q96G28 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CFAP36Q96G28 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CFAP36Q96G28 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CFAP36Q96G28 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CFAP36Q96G28 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CFAP36Q96G28 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CFAP36Q96G28 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CFAP36Q96G28 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms