Protein–RNA interactions for Protein: Q96G01

BICD1, Protein bicaudal D homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BICD1Q96G01 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BICD1Q96G01 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BICD1Q96G01 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BICD1Q96G01 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BICD1Q96G01 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BICD1Q96G01 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BICD1Q96G01 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BICD1Q96G01 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BICD1Q96G01 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BICD1Q96G01 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
BICD1Q96G01 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
BICD1Q96G01 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BICD1Q96G01 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BICD1Q96G01 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BICD1Q96G01 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BICD1Q96G01 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BICD1Q96G01 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BICD1Q96G01 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BICD1Q96G01 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BICD1Q96G01 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BICD1Q96G01 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BICD1Q96G01 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BICD1Q96G01 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BICD1Q96G01 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BICD1Q96G01 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BICD1Q96G01 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BICD1Q96G01 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BICD1Q96G01 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BICD1Q96G01 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BICD1Q96G01 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BICD1Q96G01 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BICD1Q96G01 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
BICD1Q96G01 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BICD1Q96G01 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BICD1Q96G01 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BICD1Q96G01 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BICD1Q96G01 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BICD1Q96G01 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BICD1Q96G01 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
BICD1Q96G01 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BICD1Q96G01 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
BICD1Q96G01 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BICD1Q96G01 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BICD1Q96G01 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BICD1Q96G01 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BICD1Q96G01 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms