Protein–RNA interactions for Protein: Q96BD6

SPSB1, SPRY domain-containing SOCS box protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPSB1Q96BD6 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 186.8 ms